青年武士.伊武谷萬二郎在進入劍豪.千葉周作道場修習劍道三天後,千葉周作就死了。因而無法學習劍術。此時師兄清河八郎說要教他,而萬二郎認為這可能也是取得北辰二刀流免許皆傳的機會。
一場打鬥後,萬二郎負傷回家,此時,來幫他醫治的就是手塚良仙的兒子良庵。但之後兩人卻因爭奪美女阿石而一度反目相向。不過之後他們都為各自的前程而離開江戶。這是一部以幕末時代的曾祖父為藍本的真實故事。 安政二年,江戶發生大地震。伊武谷萬二郎因引導民眾前往安全的場所避難,立下功勞一件。另一方面,手塚良仙則因受到奧醫師們的妨害,轉而與女婿大槻俊齋一起在江戶設置種痘所。